La Historia de Isla Mujeres, al igual que la totalidad de la Riviera Maya y el este de México, el Mar Caribe, está basada en los mayas, pueblo que vivió en esta tierra durante siglos, y que se vio descubierta por los españoles, quienes cambiaron la tendencia y las costumbres de la Isla. En los últimos 50 años, otra tendencia ha cambiado la isla, otra invasión, el turismo.

Durante la época maya, Isla Mujeres era un lugar de veneración a Ixchel, la Diosa de la Luna y de la Fertilidad, era un lugar de peregrinación de fieles y un santuario. Se dice que las mujeres iban a la Isla para pasar de niñas a mujeres, un paso de niña a mujer.

En el Siglo XVI los españoles llegaron a esta isla, la colonizaron y destruyeron buena parte del legado maya. Los siglos posteriores la Isla siguió con su desarrollo y se convirtió en un lugar de escalas para piratas que surcaban el caribe, era un refugio de piratas y negreros. Uno de ellos, Mundaca, aún perdura en la Isla con la Hacienda Mundaca, el lugar donde los piratas del Caribe encontraban refugio.

Ya en el Siglo XX, concretamente en la segunda mitad, sus fondos marinos, sus arrecifes de coral, sus playas… convirtieron este lugar en uno de los más destacados del mundo, en un lugar idóneo para el turismo, que busca sus playas de arena blanca y su temperatura.